Kara Gergedan Genomunu Sıralamak, Türleri Soyunun tükenmesinden Koruyabilir

21. yüzyıl biyo-mühendis olmak için harika bir zaman ve kara gergedan olmak için korkunç bir zaman. Bir yüzyıl önce 850.000 olan Afrika türleri, 5.000 civarında hızla azalan bir nüfusa boğuldu. Bir gün bu umutsuz düşüşü geri sarmak umuduyla, biyologlar, dizilimini kalabalıklaştırmaya çalışıyor diceros bicornis bicornis genom.

Proje, Washington Üniversitesi'nden patolog ve biyomühendis Dr. Charles Murray ve Pembient'in CEO'su Matthew Markus da dahil olmak üzere, korumaya yönelik çeşitli biyoteknoloji uzmanları arasında işbirliğine dayalı bir çabadır. Pembient, Çin pazarlarını sentetik - ancak biyolojik olarak özdeş - gergedan boynuzu, laboratuar yapımı keratinden basılmış ve belki de gergedan birası olarak basılmış 3D ile doldurmak isteyen bir San Francisco biyoteknoloji şirketidir. (Keratin, tırnaklarınızın ve gergedan boynuzlarının yapılmış olduğu şeylerdir. Ne büyülü ne de tıbbi değildir.) Pembient, Ntombi adlı tek bir gergedanın genomundan yeterince öğrenebilirdi, dedi Markus. Ters gergedan proteinlerini sentezleme şeklini geliştirmek için.

Ancak herhangi biri Ntombi’nin veri genetiğini benimsemeden önce, önce siyah gergedan genomu sıralanmalı. Proje, uzun süredir devam eden video oyunlarını yeniden canlandırmak yerine bilim dışındaki Kickstarter benzeri bir kitle fonlaması platformu olan Experiment.com'da 16.500 $ 'lık artırmaya yarıyor.

Murray, “Genomları dizilen nispeten az sayıda organizma var” diyor. “Çok yakın zamana kadar bu çok zordu - zaman alıcı ve pahalı.”

Bu, hayvanların kendi genlerini yapamadıklarını söylemek değildir. Genome 10K Projesi, Nuh’un genetik veri gemisini toplamayı hedefliyor. Ve daha kalabalık ve daha büyük bir tür olan güney beyaz gergedan, genomunu 2012'de sıraladı. Peki ya Ntombi gibi siyah gergedanlar? Markus, “Siyah gergedanların neden bu kadar uzun süre neden yanda kaldığı belli değil” diyor. İhmali olaya kadar itiraz ediyor; fakat, güney beyazları zaten sıralandığından, kara gergedanın öncelikli olmadığı bir şey olabilirdi.

Markus, Murray ve ortakları bu açığı kapatmayı hedefliyorlar. Projenin afiş gergedanı Ntombi çoktan kan almış ve korunmuş - ve, tombala! Gergedan DNA Murray, sekanslamanın oldukça basit olması gerektiğini söyledi. “Beyaz gergedan genomunun bir referans noktası olması büyük bir yardım”

Sıradaki sonraki adımlar

Ntombi’nin DNA'sını DNAnexsus sunucularında barındıran biyologlar, karşılaştırmalı gergedan genomiğinin temelini atmış olacak. Murray, “Bir diziyi ne zaman bir gergedan yapan, beyazın siyahtan nasıl farklılaştığını anlamaya başlayabiliriz” diyor ve “haşlanmış örnekleri izlemeye yardımcı olacak bilgiler sağlıyor”.

Veteriner hekimler, potansiyel olarak hastalığa neden olan genleri kontrol edebilir ve üçü nesli tükenmiş diğer yedi kara gergedan alt türünü karşılaştırmak için bir taban çizgisine sahip olabilir.

Yarından sonra hayvanlar

Kara gergedan genetiğini daha iyi anladıktan sonra, birkaç teorik kapı açılır. Murray, “Yolun aşağısında, gergedan fizyolojisini anlamak ve potansiyel olarak laboratuvarda gergedan boynuzu yetiştirmek için kök hücreler kullanmaktan heyecan duyuyorum” diyor.

Markus biraz daha ilerlemiş. İçin diceros bicornis bicornis Markus, çok fazla mamut tarzı neslinin tükenmesini öngörmüyor, fakat genetik saati geri sarıyor; popülasyonlar ne kadar küçük olursa, kalıtımsal problemlere o kadar eğilimli olurlar.

Ve giden siyah gergedanlar için? Bu çabayı San Diego Hayvanat Bahçesi'nde devam eden bir proje olan kuzey beyaz gergedan genomunun dizilişi ile karşılaştırıyor. Terim için kuzey beyaz bir gergedan (20.000'i vardır) taşıyacak bir güney beyaz gergedan almaya çalışmaktan bahsediyor. Markus, temkinli, dikkatli bir iyimserlikle konuşuyor: “Potansiyel olarak - potansiyel olarak - belki de nesli tükenmiş kara gergedan alt türleri yeniden canlandırılabilir.”